Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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