Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
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FOXE3Q13461 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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FOXE3Q13461 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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FOXE3Q13461 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXE3Q13461 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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