Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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