Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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