Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RIGQ13278 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RIGQ13278 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RIGQ13278 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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