Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GRIN2BQ13224 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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