Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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