Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NR1H3Q13133 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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