Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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PGGT1BP53609 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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PGGT1BP53609 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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PGGT1BP53609 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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