Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CENPFP49454 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.97□□□□□ -2.56
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CENPFP49454 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CENPFP49454 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.57
CENPFP49454 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CENPFP49454 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPFP49454 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPFP49454 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPFP49454 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPFP49454 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC-1□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPFP49454 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPFP49454 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPFP49454 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPFP49454 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
CENPFP49454 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPFP49454 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1□□□□□ -2.57
CENPFP49454 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPFP49454 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPFP49454 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPFP49454 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPFP49454 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPFP49454 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPFP49454 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.02□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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