Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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