Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ARXQ96QS3 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ARXQ96QS3 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms