Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TDRD12Q587J7 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 430.2 ms