Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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