Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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PTPRNQ16849 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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PTPRNQ16849 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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PTPRNQ16849 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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PTPRNQ16849 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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