Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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FOXD1Q16676 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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FOXD1Q16676 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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FOXD1Q16676 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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FOXD1Q16676 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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FOXD1Q16676 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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FOXD1Q16676 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
FOXD1Q16676 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
FOXD1Q16676 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
FOXD1Q16676 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
FOXD1Q16676 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
FOXD1Q16676 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
FOXD1Q16676 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
FOXD1Q16676 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
FOXD1Q16676 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
FOXD1Q16676 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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