Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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