Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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SSX1Q16384 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
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SSX1Q16384 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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SSX1Q16384 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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SSX1Q16384 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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SSX1Q16384 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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SSX1Q16384 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SSX1Q16384 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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