Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPRRQ15256 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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