Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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