Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TNIP1Q15025 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TNIP1Q15025 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TNIP1Q15025 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms