Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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SHPRHQ149N8 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHPRHQ149N8 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHPRHQ149N8 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHPRHQ149N8 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHPRHQ149N8 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHPRHQ149N8 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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SHPRHQ149N8 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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SHPRHQ149N8 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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SHPRHQ149N8 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHPRHQ149N8 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHPRHQ149N8 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHPRHQ149N8 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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SHPRHQ149N8 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
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SHPRHQ149N8 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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