Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMCO1Q147U7 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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