Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SSPNQ14714 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms