Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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