Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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