Protein–RNA interactions for Protein: Q14190

SIM2, Single-minded homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM2Q14190 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SIM2Q14190 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIM2Q14190 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIM2Q14190 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIM2Q14190 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SIM2Q14190 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SIM2Q14190 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SIM2Q14190 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SIM2Q14190 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SIM2Q14190 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SIM2Q14190 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIM2Q14190 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIM2Q14190 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIM2Q14190 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIM2Q14190 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIM2Q14190 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SIM2Q14190 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIM2Q14190 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIM2Q14190 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms