Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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