Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms