Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.1 ms