Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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