Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CUL4BQ13620 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CUL4BQ13620 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms