Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C1orf61Q13536 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
C1orf61Q13536 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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