Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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