Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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