Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MSLNQ13421 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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