Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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