Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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