Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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