Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRDNQ13061 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms