Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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