Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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KCNMA1Q12791 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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KCNMA1Q12791 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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KCNMA1Q12791 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
KCNMA1Q12791 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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