Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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