Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TMPOP42166 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TMPOP42166 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMPOP42166 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms