Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
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PTPRBP23467 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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PTPRBP23467 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
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PTPRBP23467 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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PTPRBP23467 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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PTPRBP23467 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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PTPRBP23467 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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PTPRBP23467 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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PTPRBP23467 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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