Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms