Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
STRNO43815 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
STRNO43815 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
STRNO43815 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
STRNO43815 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
STRNO43815 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
STRNO43815 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
STRNO43815 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
STRNO43815 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.5 ms