Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SOBPA7XYQ1 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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