Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM35Q9UPQ4 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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