Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNNM1Q9NRU3 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNNM1Q9NRU3 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms